La amígdala faríngea (tercera) es invisible a simple vista. Está situada detrás del paladar blando y la úvula hacia atrás y arriba siguiendo la pared posterior de la garganta. Este órgano está formado por tejido linfoide compuesto por células que eliminan microorganismos y también producen anticuerpos. La amígdala faríngea, junto con las amígdalas laterales (palatinas) y otras comunidades más pequeñas de tejido linfoide (incluidas las amígdalas de la trompa, de la lengua), constituye la barrera protectora del organismo (el llamado anillo linfático faríngeo).